马桶底部存水小是因为下水道可能存在一些阻塞或者堵塞的情况，导致水流无法顺畅流动。另外，马桶排水管道内如果长时间不清理或者被一些异物堵塞也可能导致底部存水小。其次，底部存水小还可能是由于排水系统安装不当或者底部密封不严密导致的。以下是详细的解释：
1. 下水道堵塞：下水道堵塞是马桶底部存水小的主要原因。下水道中经常会有固体物和其他的杂物因为各种原因而被卡住，从而导致排水不畅。如果情况比较严重，可能需要专业的管道清洗服务来解决。
2. 排水管长期不清理: 马桶排水管道中如果长时间不清理，会有大量的污垢和细菌粘附在管道内部，使管道变狭窄，从而导致排水不畅，底部存水小。
3. 管道安装不当: 马桶排水管道的安装不当也可能是底部存水小的原因。如果安装时位置不正确或者角度不正确，就会导致水流无法顺畅流向下水道。
4. 底部密封不严: 马桶底部的密封不严也是底部存水小的原因。如果密封不严，就会导致水从底部渗漏出来，不仅影响清洁卫生，而且还会使底部存水变小。
综上所述，马桶底部存水小的原因可能有很多，需要根据具体情况进行分析和处理。建议及时请专业人士来清理管道，或者检查排水管道的安装情况和密封是否合格，以保证马桶正常使用。
